По официальной версии Волховская ГЭС не оказывает существенного влияния на уровень воды выше и ниже по течению. Однако новгородские рыбаки утверждают, что пороги, имеющиеся перед ГЭС, удерживают лед и влияют на повышение уровня воды реки Волхов на территории Новгородской области и Великого Новгорода, в частности.